我院曾祥羽教师团队在《Mycosphere》上发表创新型交叉学科论文
基于DNA序列的系统发育分析在现代真菌分类学研究中是不可缺少的一环,但系统发育分析的过程相对复杂,其间的操作和分析很容易出错,不同研究人员得出的结果可靠性和可重复性较低,且获得一棵稳定、合理的系统发育树往往需要重复测试不同的数据集,这将会花费研究人员大量的时间来执行许多重复性的操作。
针对现有某些软件能提供部分或全部系统发育分析功能操作频繁、功能过于单一而无法完成整个建树流程等缺陷,农学院植物病理学科曾祥羽团队开发了“一键式真菌系统发育分析软件”(简称:OFPT)。该软件将构建系统发育树的重复过程自动化和标准化,研究者只需要准备一个带有DNA登录号的Excel文件就可以利用软件自动生成相应的系统发育树。使用该软件将大大提高系统发育分析的效率和系统发育树的可靠性。该成果已获得相应的计算机软件著作权(登记号:2023SR1445017),相关论文发表在了真菌学领域著名期刊Mycosphere(IF=14.6)上。
软件主界面
该研究得到了贵州省自然科学基金、国家自然科学基金、国家留学基金、贵州大学特岗启动项目的资助。相应软件可从https://ofpt.guhongxin.com网站下载和使用。
输入Excel表
参数记录文件
图文:曾祥羽教师团队
编审:赵路玥
二审:王明
三审:杨刚